與大多數其他類型的驅動程式不同，檔案系統密切參與正常的安全處理。 這是因為安全性的性質及其在 Microsoft Windows 中的實作。 一般 Windows 安全性模型會將安全性描述元與物件產生關聯，在此案例中為FILE_OBJECT。 支援 Windows 安全性的檔案系統負責儲存和擷取安全性描述元。 此外，檔案系統會負責處理數個其他特殊安全性考慮，這些考慮不屬於標準核心模式驅動程式的正常範圍。
本節討論可新增至檔案系統以支援 Windows 安全性的主要功能。 這些都不是強制性的，並且可以在不使用任何這些介面的情況下建構檔案系統。 此外，可以實作某些安全性特性，而忽略其他安全性特性，這是檔案系統實作所特有的。
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